circRNA測序

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勇攀circRNA研究巔峰

環狀RNA(circular RNA, circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分析,
測序采用Illumina測序平臺進行測序,針對有參考基因組樣本開展準確的circRNA鑒定
以及來源基因的分析,環狀RNA測序在醫學、農學研究領域應用越來越廣泛。

平臺優,周期短,性價比高。

基于高通量測序,依據主流數據庫和circRNA鑒定軟件,
分析項目物種的circRNA信息,深入挖掘circRNA在轉錄調控中所發揮的重要功能。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

諾禾致源circRNA測序項目,通過高效富集circRNA,借助最主流軟
件對circRNA進行鑒定,并通過分析來源基因,以深化對項目物種
circRNA的功能研究。

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分析內容 解決問題
參考序列比對 分析測序reads比對率和覆蓋度
circRNA鑒定 發現樣本中存在的circRNA
circRNA來源基因分析 有助于明確哪些基因能夠形成circRNA
circRNA表達水平定量 circRNA在各個樣本中的表達水平
差異表達分析 樣本之間差異表達的circRNA
GO、KEGG富集分析 明確來源基因的具體生物學功能
miRNA結合位點預測 circRNA發揮海綿效應的基礎

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

環狀RNA測序采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

出色完成每一個項目環節

至2015年12月,諾禾致源已經成功對人、鼠、羊、豬、雞、斑馬魚、果蠅、
家蠶、蜜蜂、線蟲、擬南芥、油菜、水稻、棉花、稻瘟菌等30多個物種進行circRNA測序分析,
做為一種相對較新的RNA測序產品,circRNA廣受關注,大量研究成果發表在權威期刊。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。

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