比較轉錄組與泛轉錄組測序

產品介紹常見問題經典案例結果展示


比較轉錄組與泛轉錄組測序

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借轉錄組研究之力解秘物種進化

比較轉錄組測序是基于Illumina測序平臺,通過RNA-seq技術手段研究物種進化,
通過不同物種或亞種間mRNA序列差異進而分析近源物種間的親緣關系,
挖掘明顯受到正向選擇或負向選擇的基因。泛轉錄組測序不僅能分析比較轉錄組的內容,
同時還可以構建共表達網絡,挖掘關鍵基因模塊。

高效,精準,超值。

比較轉錄組與泛轉錄組測序是一種快速、全面解析不同品系、
不同亞種進化關系及特定組織表達情況的生物學方法,以期從序列水平
和基因表達水平發掘物種進化歷程。 具有“高效、基因定位準、超值”的優勢,
已廣泛應用于水稻、擬南芥、番茄等物種的進化研究。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

諾禾致源比較轉錄組與泛轉錄組測序,通過對樣本的轉錄本進行單獨拼
接,篩選直系同源基因,研究進化關系,挖掘主效基因集。

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分析內容
轉錄本拼接
直系同源基因查找
直系同源基因Ka/Ks分析
PCA分析
系統進化樹構建
表達水平進化分析(泛轉錄組特有)
共表達網絡模塊構建(泛轉錄組特有)

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

比較轉錄組與泛轉錄組采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

出色完成每一個項目環節

至2015年12月,諾禾致源已經成功對番茄、苧麻、裂腹魚、蛙、
沙拐棗、枸杞、核桃、黃岑等30多個物種進行比較轉錄組或泛轉錄組測序分析,
已在Plant Molecular Biology等權威期刊發表多篇研究成果。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。

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