宏基因組測序

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結果展示

代謝通路分析

通過KEGG基因功能注釋,分析各樣品中與關鍵功能相關的代謝通路中基因的分布情況,及其豐度情況,比較不同分組間關鍵代謝通路的差異。從功能基因及代謝通路的層面來說明對照樣品的關鍵物質代謝路線及含量差異的原因。

組間功能差異分析

為了研究組間具有顯著性差異的功能,從不同層級的功能相對豐度表出發,利用 Metastats 方法篩選具有顯著性差異的功能,然后繪制箱形圖,箱形圖可直觀清晰的展示差異功能在組間的豐度分布。

抗性基因分析

通過CARD數據庫的注釋,可以找到
抗生素抗性基因、以及作用機制等信息,
抗性基因Overview圈圖可以從整體上觀察各樣品中抗性基因豐度占比
,更加直觀的展示各抗性基因豐度的整體分布情況。

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