宏轉錄組測序

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結果展示

De novo拼接

使用優質的拼接軟件分別進行從頭組裝,然后對所有樣品的序列進行整合并去冗余、低質量序列等,得到unigene 集合。

物種注釋

mRNA與從NCBI的NR數據庫中抽提出的細菌(Bacteria)、真菌(Fungi)、古菌(Archaea)和病毒(Viruses)數據進行比對,然后結合基因的表達豐度信息進行物種的注釋和分類。

功能注釋

CAZy(Carbohydrate-Active Enzymes Database)是研究碳水化合物酶的專業級數據庫,主要涵蓋6大功能類:糖苷水解酶,糖基轉移酶,多糖裂合酶,碳水化合物酯酶,輔助氧化還原酶和碳水化合物結合模塊。

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