微生物重測序

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一站式解析變異與差異

微生物種類繁多,菌株的分化速度快,需要有一個經濟快速的方法,
對大范圍內的海量菌株進行測序研究,了解菌株間的變異信息。
微生物基因組的重測序,是基于小片段文庫的高通量測序數據,與近緣參考基因組進行比對,進行變異檢測的方法。
檢測獲得菌株和參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息,以精準快捷為特點,
系統全面的檢測變異信息。同時還可進一步進行物種進化、種群特征、選擇壓力等研究。

精準、快捷、多樣化重測序方案

微生物重測序產品,以精準快捷為核心,切中核心目標,
準確檢測菌株間的重要變異信息。

產品 測序平臺 測序策略 檢測內容 項目周期
細菌重測序 Illumina PE150 350 bp文庫 ≥ 100 X SNP、InDel、SV 30個自然日
真菌重測序 Illumina PE150 350 bp文庫 ≥ 30 X SNP、InDel、SV、CNV 30個自然日

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

分析內容=標準分析+高級分析。
深入到位的數據分析可系統、全面了解樣本的信息。變異檢測只是重
測序的數據基礎,基于數據的挖掘,才是解釋生物學問題的橋梁。一
系列的信息分析,幫助我們更好的解讀數據,了解菌株進化、選擇和
傳播等重要問題。

分析內容 解決問題
變異檢測 準確定位變異位點
基本進化分析 構建系統進化樹
確定菌株間進化關系
地域歸屬分析 研究菌株的地域傳播規律
分歧時間估計 討論菌株支系之間的分化歷史
選擇壓力分析 菌株進化過程中的選擇壓力
揭示與環境相關的關鍵基因
變異基因功能富集 統計變異基因分布規律
尋找變異豐富的功能分類

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

微生物基因組重測序采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

出色完成每一個項目環節

諾禾致源微生物合作遍布全球,截止2017年12月,已發表20余篇微生物文章,微生物單菌完成樣品數超過20000例,
項目合作領域涵蓋了致病菌、益生菌、食用菌、藥用菌株、工業菌株等廣泛領域。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。

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